He actualizado eclipse a la versión Europa (3.1.1) y CDT a (4.0.1) en extra, tras un corto periodo en testing.
Con esta versión eclipse se mueve de /opt a /usr/share y de abandona el soporte a JDK 1.4.x el cual tiene una antigí¼edad de varios años y no es tan fácil de mantener.
Si dependes de JDK 1.4.x y estás deseando modificar nuestro paquete de eclipse para soportarlo mejor, por favor, abre una petición de característica en Flyspray.